Dall'8 maggio 2008 Zaia ricopre l'incarico di Ministro delle Politiche agricole alimentari e forestali nel IV Governo Berlusconi.

Obiettivo primario della sua azione politica è riportare al centro del dibattito, nazionale ed internazionale, i valori dell'agricoltura e dell'economia reale. Per questo, sin dall'insediamento, è impegnato in prima linea nel confronto negoziale con l'Unione Europea.

Bruxelles diviene la sua seconda casa. Grazie a questa puntuale presenza, l'Italia ha ottenuto dall'Europa oltre 4 miliardi e 300 milioni di euro, da investire in innovazione, qualità ed aggregazione e in misure per favorire il ricambio generazionale e il ritorno dei giovani alla terra.

In questi ultimi tempi si è avuto, grazie a lui, una particolare attenzione da parte del MIPAAF nei confronti del settore apicoltura, vedi intervista al ministro Luca Zaia.